1990年3月，根据最高人民法院法(交)函［1989］36号文件的通知，海口海事法院正式成立。其管辖范围包括海南省所属港口和水域以及西沙、中沙、南沙、黄岩岛等岛屿和水域内发生的一审海事、海商案件。

海口海事法院刚成立时内设海事审判庭、海商审判庭、办公室和研究室等四个职能部门。为适应审判工作的需要，1996年增设执行庭；2002年3月增设政治部、立案庭、审判监督办公室，逐步健全了内部机构设置，较好地体现了立审分离、审执分离、审监分立的司法原则。海口海事法院现有在编人员43人，其中法官24人。在法官队伍中，拥有大学本科以上学历的占75％，拥有硕士学位的占33％。

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